MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015184	ACT	2	6	280863	280868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168601
5502	NC_015184	CAG	2	6	280879	280884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5503	NC_015184	CTG	2	6	280898	280903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5504	NC_015184	CAAC	2	8	280923	280930	50 %	0 %	0 %	50 %	325168601
5505	NC_015184	GACG	2	8	280931	280938	25 %	0 %	50 %	25 %	325168601
5506	NC_015184	TGCA	2	8	280955	280962	25 %	25 %	25 %	25 %	325168601
5507	NC_015184	CGT	2	6	280975	280980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5508	NC_015184	GC	3	6	281021	281026	0 %	0 %	50 %	50 %	325168601
5509	NC_015184	CTG	2	6	281111	281116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5510	NC_015184	AGC	2	6	281154	281159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5511	NC_015184	TCGA	2	8	281206	281213	25 %	25 %	25 %	25 %	325168601
5512	NC_015184	GTC	2	6	281225	281230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5513	NC_015184	GGC	2	6	281234	281239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168601
5514	NC_015184	CG	3	6	281250	281255	0 %	0 %	50 %	50 %	325168601
5515	NC_015184	AGA	2	6	281268	281273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168601
5516	NC_015184	TGC	2	6	281279	281284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5517	NC_015184	GCC	2	6	281287	281292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168601
5518	NC_015184	GTC	2	6	281299	281304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5519	NC_015184	GCT	2	6	281357	281362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5520	NC_015184	CGT	2	6	281371	281376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5521	NC_015184	GTCG	2	8	281412	281419	0 %	25 %	50 %	25 %	325168601
5522	NC_015184	GCCGA	2	10	281656	281665	20 %	0 %	40 %	40 %	325168601
5523	NC_015184	CCG	2	6	281671	281676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168601
5524	NC_015184	TCG	2	6	281718	281723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5525	NC_015184	CAG	2	6	281826	281831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5526	NC_015184	GAC	2	6	281881	281886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168601
5527	NC_015184	CGGCG	2	10	281967	281976	0 %	0 %	60 %	40 %	325168601
5528	NC_015184	T	6	6	282082	282087	0 %	100 %	0 %	0 %	325168601
5529	NC_015184	CCG	2	6	282098	282103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168601
5530	NC_015184	GAT	2	6	282141	282146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168601
5531	NC_015184	GGGC	2	8	282209	282216	0 %	0 %	75 %	25 %	325168601
5532	NC_015184	GCG	2	6	282217	282222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168601
5533	NC_015184	TC	3	6	282312	282317	0 %	50 %	0 %	50 %	325168601
5534	NC_015184	TCT	2	6	282388	282393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_015184	CGC	3	9	282502	282510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168602
5536	NC_015184	TCA	2	6	282568	282573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168602
5537	NC_015184	ACT	2	6	282594	282599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168603
5538	NC_015184	ATCAA	2	10	282604	282613	60 %	20 %	0 %	20 %	325168603
5539	NC_015184	GC	3	6	282620	282625	0 %	0 %	50 %	50 %	325168603
5540	NC_015184	GCT	2	6	282637	282642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168603
5541	NC_015184	GC	3	6	282659	282664	0 %	0 %	50 %	50 %	325168603
5542	NC_015184	GAT	2	6	282771	282776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_015184	TCG	2	6	282841	282846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168604
5544	NC_015184	CCGA	2	8	282859	282866	25 %	0 %	25 %	50 %	325168604
5545	NC_015184	GA	3	6	283048	283053	50 %	0 %	50 %	0 %	325168604
5546	NC_015184	AGAGA	2	10	283122	283131	60 %	0 %	40 %	0 %	325168605
5547	NC_015184	CATA	2	8	283235	283242	50 %	25 %	0 %	25 %	325168605
5548	NC_015184	GCC	2	6	283379	283384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168605
5549	NC_015184	TCT	2	6	283421	283426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168605
5550	NC_015184	CG	3	6	283486	283491	0 %	0 %	50 %	50 %	325168605
5551	NC_015184	GTCC	2	8	283503	283510	0 %	25 %	25 %	50 %	325168605
5552	NC_015184	GCC	2	6	283554	283559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_015184	TGC	2	6	283602	283607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_015184	TAT	2	6	283652	283657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015184	TGCC	2	8	283761	283768	0 %	25 %	25 %	50 %	325168606
5556	NC_015184	CAT	2	6	283819	283824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168606
5557	NC_015184	TTC	2	6	283846	283851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168606
5558	NC_015184	CGCC	2	8	283944	283951	0 %	0 %	25 %	75 %	325168606
5559	NC_015184	AGA	2	6	283986	283991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168606
5560	NC_015184	CAG	2	6	283998	284003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168606
5561	NC_015184	GTC	2	6	284017	284022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168606
5562	NC_015184	CGT	2	6	284026	284031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168606
5563	NC_015184	ATG	2	6	284141	284146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168606
5564	NC_015184	CCG	2	6	284289	284294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168606
5565	NC_015184	CAG	2	6	284325	284330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168606
5566	NC_015184	CGA	2	6	284415	284420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168606
5567	NC_015184	GCT	2	6	284457	284462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168606
5568	NC_015184	TCA	2	6	284519	284524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168606
5569	NC_015184	GGA	2	6	284553	284558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168606
5570	NC_015184	GAAGA	2	10	284686	284695	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_015184	GAT	2	6	284705	284710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_015184	GCC	2	6	284935	284940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168607
5573	NC_015184	TGC	2	6	284967	284972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_015184	CAC	2	6	284973	284978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_015184	ATCGAG	2	12	284991	285002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5576	NC_015184	AGC	2	6	285024	285029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_015184	GGC	2	6	285057	285062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_015184	C	6	6	285064	285069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5579	NC_015184	TGA	2	6	285070	285075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015184	CTT	2	6	285145	285150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168608
5581	NC_015184	TGG	2	6	285168	285173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168608
5582	NC_015184	CGT	2	6	285271	285276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168608
5583	NC_015184	CGA	2	6	285297	285302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168608
5584	NC_015184	CGA	2	6	285351	285356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168608
5585	NC_015184	GCG	2	6	285432	285437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168609
5586	NC_015184	CTT	2	6	285476	285481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168609
5587	NC_015184	CAT	2	6	285540	285545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168609
5588	NC_015184	ACG	2	6	285608	285613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168609
5589	NC_015184	GTG	2	6	285706	285711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168609
5590	NC_015184	GATG	2	8	285799	285806	25 %	25 %	50 %	0 %	325168610
5591	NC_015184	ATC	2	6	285832	285837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168610
5592	NC_015184	TCG	2	6	285882	285887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168610
5593	NC_015184	AGG	2	6	285978	285983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015184	GCG	2	6	286007	286012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_015184	CGA	2	6	286017	286022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015184	TTC	2	6	286093	286098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_015184	TGA	2	6	286176	286181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168611
5598	NC_015184	GAT	3	9	286344	286352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168612
5599	NC_015184	CGGC	2	8	286401	286408	0 %	0 %	50 %	50 %	325168612
5600	NC_015184	GCGG	2	8	286524	286531	0 %	0 %	75 %	25 %	325168612
5601	NC_015184	CAT	2	6	286644	286649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168612
5602	NC_015184	CG	3	6	286676	286681	0 %	0 %	50 %	50 %	325168612
5603	NC_015184	AAC	2	6	286732	286737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168612
5604	NC_015184	ATC	2	6	286768	286773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168612
5605	NC_015184	GAT	2	6	286791	286796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168612
5606	NC_015184	CCGA	2	8	286800	286807	25 %	0 %	25 %	50 %	325168612
5607	NC_015184	TCTT	2	8	286855	286862	0 %	75 %	0 %	25 %	325168612
5608	NC_015184	GCA	2	6	287051	287056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5609	NC_015184	AGA	2	6	287152	287157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168612
5610	NC_015184	CAG	2	6	287163	287168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5611	NC_015184	CGA	2	6	287202	287207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5612	NC_015184	T	6	6	287266	287271	0 %	100 %	0 %	0 %	325168612
5613	NC_015184	CAA	2	6	287333	287338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168612
5614	NC_015184	GGT	2	6	287363	287368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168612
5615	NC_015184	ACG	2	6	287443	287448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5616	NC_015184	TGG	2	6	287453	287458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168612
5617	NC_015184	GAA	2	6	287481	287486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168612
5618	NC_015184	TCGAA	2	10	287498	287507	40 %	20 %	20 %	20 %	325168612
5619	NC_015184	CAG	2	6	287523	287528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5620	NC_015184	CCA	2	6	287539	287544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168612
5621	NC_015184	CAT	2	6	287636	287641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168612
5622	NC_015184	GCC	3	9	287656	287664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168612
5623	NC_015184	GC	3	6	287707	287712	0 %	0 %	50 %	50 %	325168612
5624	NC_015184	ACG	2	6	287728	287733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5625	NC_015184	GC	3	6	287742	287747	0 %	0 %	50 %	50 %	325168612
5626	NC_015184	GCC	2	6	287758	287763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168612
5627	NC_015184	CGA	2	6	287801	287806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5628	NC_015184	CT	3	6	287839	287844	0 %	50 %	0 %	50 %	325168612
5629	NC_015184	GCC	2	6	287858	287863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168612
5630	NC_015184	CAG	2	6	287964	287969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168612
5631	NC_015184	CCAG	2	8	287971	287978	25 %	0 %	25 %	50 %	325168612
5632	NC_015184	ATG	2	6	288112	288117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168612
5633	NC_015184	CG	3	6	288323	288328	0 %	0 %	50 %	50 %	325168613
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5635	NC_015184	CTT	2	6	288368	288373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168613
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5637	NC_015184	TCG	2	6	288496	288501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168614
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5639	NC_015184	ATCTCC	2	12	288529	288540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325168614
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5643	NC_015184	CAG	2	6	288780	288785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5644	NC_015184	AGC	2	6	288802	288807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5646	NC_015184	CAG	2	6	288920	288925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168615
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5652	NC_015184	GC	3	6	289079	289084	0 %	0 %	50 %	50 %	325168615
5653	NC_015184	CGT	2	6	289103	289108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168615
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5656	NC_015184	CA	3	6	289312	289317	50 %	0 %	0 %	50 %	325168615
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5663	NC_015184	CG	3	6	289667	289672	0 %	0 %	50 %	50 %	325168615
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5744	NC_015184	GCTC	2	8	293251	293258	0 %	25 %	25 %	50 %	325168615
5745	NC_015184	CGA	2	6	293303	293308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168615
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5873	NC_015184	TCA	2	6	301041	301046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168626
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5988	NC_015184	CAG	2	6	307908	307913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168635
5989	NC_015184	ATCG	2	8	307914	307921	25 %	25 %	25 %	25 %	325168635
5990	NC_015184	TCCGA	2	10	307922	307931	20 %	20 %	20 %	40 %	325168635
5991	NC_015184	AGC	2	6	308015	308020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_015184	TAA	2	6	308049	308054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5993	NC_015184	GAT	2	6	308093	308098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5994	NC_015184	GCA	2	6	308123	308128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5995	NC_015184	AAC	2	6	308146	308151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5996	NC_015184	TCA	2	6	308162	308167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5997	NC_015184	TTCC	2	8	308168	308175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5998	NC_015184	TTC	2	6	308180	308185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5999	NC_015184	CG	3	6	308203	308208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6000	NC_015184	GCC	2	6	308232	308237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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